Targeted Panel
Sequenzierung

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Was wir anbieten

Panel-Vielfalt
Wir bieten hauseigene MLL-Panels an, aber auch individuell gestaltete Panels. Spike-in-Panels ermöglichen eine noch größere Vielfalt.

Robust und standardisiert
Erfahrung mit vollautomatischen Verfahren und hohem Durchsatz in einem diagnostischen Umfeld

Tiefe Sequenzierung
wir zielen im Median auf >1.500x mit einer Mindestabdeckung von 400x und erreichen damit eine hohe Sensitivität.

schnelle Bearbeitungszeit
für Library Vorbereitung, Sequenzierung und Varianten Interpretation für unsere hämatologischen Panels

Unser Prozess

In diesem Workflow bündeln wir bei MLLSEQ unsere maximale Erfahrung aus der Diagnostik. Das Ergebnis ist ein Workflow, der von höchster Datenqualität, standardisiert, robust und täglich im hohen Durchsatz verarbeitet wird. Wir sind stolz auf unseren Blockbuster und freuen uns, ein paar Details mit Ihnen zu teilen.

1

Library Vorbereitung

Wir verwenden verschiedene Ansätze für die Targeted Panel Library Prep:

  • TruSeq DNA Nano (Ultraschall, Amplifikation, Illumina)
  • Illumina DNA Prep (Tagmentierung, Amplifikation, Illumina)
  • xGen cfDNA & FFPE Library Prep (keine Fragmentierung, Amplifikation, IDT)

gefolgt von xGen Lockdown Panels und dem xGen Hybridisierungs-Workflow (IDT)

  • TruSight Oncology 500 (Illumina)

2

Sequenzierung

Bei MLLSEQ wird die Sequenzierung mit der Illumina Sequencing by Synthesis Methode auf der neuesten Generation von Sequenziergeräten, dem NovaSeq 6000, oder dem MiSeq durchgeführt. Die Sequenzierungstiefe (Coverage) hängt von der jeweiligen Anwendung und Forschungsfrage ab.

3

Datenanalyse

Wir bieten browserbasierte Anwendungen für die Interpretation von kleinen molekulargenetischen Veränderungen:

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